该比赛的历史可追溯至1965年，最初是以青年演奏家双年展形式在维尔纽斯举办。
赛事以立陶宛著名作曲家、钢琴家及教育家斯坦西斯·瓦伊纽纳斯的名字命名，他是立陶宛首位国际比赛获奖者（1933年维也纳国际比赛）。
1989年首届全国性瓦伊纽纳斯钢琴比赛举办，1993年赛事正式升级为国际赛事，先后由立陶宛文化教育部、文化部主管；
2006年起，赛事新增室内乐合奏组别，成为兼具钢琴独奏与室内乐演奏的综合性国际赛事。
如今，该赛事已是国际音乐比赛世界联合会（WFIMC）、青年音乐比赛欧洲联盟（EMCY）及阿林克 - 阿格里奇基金会成员，为全球青年音乐人才提供了高水准的展示与交流平台，也成为波罗的海地区音乐文化交流的重要名片。
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